Los documentos constitutivos de este Fondo, en cumplimiento de la Pragmática de 1503, fueron custodiados por los escribanos que los produjeron y por sus sucesores en cada escribanía hasta su ingreso en el Archivo. En virtud del Decreto de 12 de noviembre de 1931 se inicia, desde 1966, el ingreso de estos documentos en el Archivo Histórico de Protocolos de Madrid, correspondiendo la propiedad y custodia sobre los mismos al Ministerio de Instrucción Pública y Bellas Artes que, con sus distintas denominaciones, la ejerce hasta la creación del Ministerio de Cultura en 1977. En la actualidad, aunque mantienen la titularidad estatal, la gestión corresponde a la Comunidad de Madrid, a la que fue transferida por Real Decreto de 19 de abril de 1985.